Éric Aubin est titulaire d’un baccalauréat (1998) ainsi que d’une maîtrise (2006) dans le programme de microbiologie de l’Université Laval. En 2011, il y complète un doctorat en microbiologie et s’y spécialise en immunologie. Dans le cadre de ses études doctorales, il obtient une bourse octroyée par Héma-Québec et y étudie les mécanismes d’action des immunoglobulines intraveineuses (IgIV) sur la réponse immunitaire.

Monsieur Aubin poursuit par la suite sa carrière dans le milieu pharmaceutique et l’industrie du vaccin en tant que scientifique en études pré-cliniques et cliniques.

C’est en 2019 que monsieur Aubin devient professionnel scientifique en santé à l’INESSS, au sein de la Direction du médicament, secteur de l'usage optimal du médicament.